この記事は2017年1月30日に書かれたもので、内容が古い可能性がありますのでご注意ください。
スライダーでよく使用するFlexSlider 2ですが、
IEで確認したところ切り替え時にfadeされなかったため、jquery.flexslider-min.jsを修正すると問題なくfadeされました。（ver.は2.6.3）
vars.animationSpeed/1e3+"s ease"
このワードの後ろに下記を追記します。
,transition:"opacity 2s"
こちらのサイトを参考にし、この原因をfixすることができました。
IE11でflexsliderをfadeさせる
